More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1070 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.74 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.74 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.39 
 
 		 288 aa  262  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  38.76 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.38 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.32 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.35 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  32.32 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.13 
 
 		 332 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 331 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  29.74 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0052  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.67 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  30.51 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.1 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  33.69 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.97 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.97 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  31.97 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0687  oxidoreductase family protein  28.62 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00761279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  25.95 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  31.97 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 360 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  30.69 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  26.98 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  29.96 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  29.66 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  28.97 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 361 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  30.86 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  29.96 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  29.31 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  25.87 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  36.96 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0906  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  32.4 
 
 		 356 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  32.58 
 
 		 355 aa  95.5  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 327 aa  92.4  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 320 aa  92.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  33.14 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 		 344 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.36 
 
 		 345 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  23.36 
 
 		 340 aa  89  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  34.66 
 
 		 353 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.04 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  24.04 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0987  oxidoreductase family protein  29.93 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.827263  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.77 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  24.2 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  23.81 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  31.76 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  22.77 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.81 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  25.25 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  25.25 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.38 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  26.26 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  27.07 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.88 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  23.78 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  26.26 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>