More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3103 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
367 aa  753    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  55.43 
 
 
369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  55.16 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  50.95 
 
 
368 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  51.12 
 
 
366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  50.14 
 
 
374 aa  352  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  51.98 
 
 
365 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  46.8 
 
 
368 aa  346  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  48.32 
 
 
370 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  50.73 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  50.88 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  44.59 
 
 
377 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  49.56 
 
 
366 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  45.72 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  48.87 
 
 
357 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  43.78 
 
 
377 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  49.01 
 
 
366 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  43.51 
 
 
377 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  51.37 
 
 
375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  42.47 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  47.65 
 
 
380 aa  302  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  46.22 
 
 
379 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  42.97 
 
 
377 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  47.35 
 
 
378 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  42.33 
 
 
377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  46.11 
 
 
368 aa  288  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  43.77 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  41.69 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  43.06 
 
 
373 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  45.01 
 
 
366 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  42.47 
 
 
382 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  41.92 
 
 
382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  42.53 
 
 
371 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  41.57 
 
 
357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  41.32 
 
 
383 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  43.72 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  43.65 
 
 
373 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  42.06 
 
 
383 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  41.5 
 
 
380 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  39.55 
 
 
379 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  43.06 
 
 
368 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 
356 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
644 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 
358 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 
369 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
364 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
352 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  33.75 
 
 
657 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  33.58 
 
 
376 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.24 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.24 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 
378 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.85 
 
 
665 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
358 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 
387 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.01 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.26 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.8 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.07 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  24.65 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.76 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
383 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.14 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  28.06 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  22.79 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  36.28 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  22.79 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  28.21 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>