More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0768 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0768  galactose 1-dehydrogenase  100 
 
 		 308 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0771142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1072  Galactose 1-dehydrogenase  80.52 
 
 		 308 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524055  decreased coverage  0.00000279105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1217  Galactose 1-dehydrogenase  79.55 
 
 		 308 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262624  decreased coverage  0.00000117945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3077  galactose 1-dehydrogenase  61.04 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.212276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1017  galactose 1-dehydrogenase  60.39 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2134  galactose 1-dehydrogenase  59.42 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3971  galactose 1-dehydrogenase  59.02 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0549531  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1330  galactose 1-dehydrogenase  59.61 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4216  galactose 1-dehydrogenase  58.31 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552547  normal  0.714025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1420  galactose 1-dehydrogenase  57.65 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0843  galactose 1-dehydrogenase  56.25 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0883  putative D-galactose 1-dehydrogenase  56.07 
 
 		 341 aa  351  8.999999999999999e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0941  D-galactose 1-dehydrogenase, putative  56.07 
 
 		 311 aa  350  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2597  Galactose 1-dehydrogenase  56.86 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3007  Galactose 1-dehydrogenase  56.72 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4922  galactose 1-dehydrogenase  54.79 
 
 		 309 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3616  galactose 1-dehydrogenase  54.98 
 
 		 318 aa  340  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4587  galactose 1-dehydrogenase  54.93 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5217  D-galactose 1-dehydrogenase  54.93 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5642  galactose 1-dehydrogenase  54.93 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00221401  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5477  galactose 1-dehydrogenase  54.46 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0273658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3205  galactose 1-dehydrogenase  54.46 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0043  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  54.46 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04345  galactose 1-dehydrogenase  53.47 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1629  dehydrogenase  54.97 
 
 		 309 aa  331  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0358495  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4245  galactose 1-dehydrogenase  54.75 
 
 		 303 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3910  dehydrogenase  48.51 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4782  D-galactose 1-dehydrogenase  47.4 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4331  D-galactose 1-dehydrogenase  48.7 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4632  galactose 1-dehydrogenase  51.16 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0745  D-galactose 1-dehydrogenase  40.07 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  32.76 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  24.08 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  32.2 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  28.65 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.7 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  24.62 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  30.77 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  30.87 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  26.41 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  30.61 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  29.94 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  24.38 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.8 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.78 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.78 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.27 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  24.4 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.87 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.87 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  30.67 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  21.67 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  24.1 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.05 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.58 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 375 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0692  NADH-dependent dehydrogenase  31.58 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.62 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>