More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4060 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 334 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  39.63 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  34.42 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  35.59 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2047  putative oxidoreductase  31.83 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2532  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.069411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1191  oxidoreductase family protein  32.38 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  36.16 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1447  oxidoreductase family, NAD-binding  32.38 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01064  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.38 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2578  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01072  hypothetical protein  32.38 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1191  oxidoreductase family protein  32.38 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2061  oxidoreductase family protein  32.06 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2793  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.219606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2273  oxidoreductase domain protein  43.07 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1582  oxidoreductase domain-containing protein  36.65 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0160  oxidoreductase domain-containing protein  22.64 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1162  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 294 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4807  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.32 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4805  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.31 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2322  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4789  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.32 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0455  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.32 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0435849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4420  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.48 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2082  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.284324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4568  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4923  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.79 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4784  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.2 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  28.25 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4500  oxidoreductase domain-containing protein  25.24 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1237  Virulence factor MviM homolog  39.86 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2019  Virulence factor MviM homolog  39.13 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1281  putative Virulence factor MviM homolog  39.13 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.331996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2203  oxidoreductase family protein  39.13 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1266  hypothetical protein  39.13 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  normal  0.136128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.97 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 1079 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.87 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.61 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  22.49 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0322  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.552303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3535  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  32.37 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  24.6 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 1080 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.02 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  38.57 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  29.87 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  33.58 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  28.07 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  27.62 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3366  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  27.67 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1183  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.8 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  27.2 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.53 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000584  oxidoreductase Gfo/Idh/MocA family  29.92 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  31.05 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  35.46 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.49 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64256  probable oxidoreductase  25.68 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0428104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>