More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 403 aa  818    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  56.07 
 
 		 390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  56.27 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  54.31 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  53.12 
 
 		 699 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  50.26 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  50.26 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  50.26 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  49.06 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  55.47 
 
 		 405 aa  336  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  51.72 
 
 		 227 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  23.64 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  23.64 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  25.07 
 
 		 400 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25.39 
 
 		 496 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.67 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  25.8 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  24.39 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  32.08 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  27.24 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 495 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 345 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 356 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.91 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.01 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  28.12 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.5 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.33 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  28.95 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  22.6 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  21.86 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.35 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  21.51 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  28.21 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  25.66 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  27.62 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  28.97 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  21.2 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  25.5 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.57 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.36 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>