More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1658 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
405 aa  815    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  56.69 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  59.11 
 
 
390 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  55.73 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  55.88 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  53.45 
 
 
699 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  57.22 
 
 
396 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  55.3 
 
 
397 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  53.28 
 
 
399 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  52.51 
 
 
390 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  34 
 
 
474 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  30.28 
 
 
444 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  22.07 
 
 
421 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
425 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  26.22 
 
 
455 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  22.07 
 
 
421 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
435 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
425 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
414 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
429 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
496 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.95 
 
 
421 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
431 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  36.18 
 
 
495 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  27.08 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  29.11 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 
431 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  36.05 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  35.53 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  37.8 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
311 aa  90.1  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.88 
 
 
312 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  22.86 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
344 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 
368 aa  86.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  28.32 
 
 
346 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 
375 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  30.8 
 
 
450 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  22.96 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  21.25 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.3 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.38 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.98 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  23.74 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.11 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.67 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  23.47 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  22.46 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.67 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  21.37 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
715 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  29.29 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
359 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  30.37 
 
 
336 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  31.58 
 
 
330 aa  77  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  27.93 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.55 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  25.57 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  29.85 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  28.86 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>