More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0594 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 399 aa  812    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  57.22 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  55.81 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  54.15 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  56.4 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  50.26 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  52.69 
 
 		 699 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  53.51 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  48.21 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  53.41 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  54.95 
 
 		 227 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  23.27 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  23.27 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.81 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  25.51 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  34.9 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  29.2 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  23.85 
 
 		 455 aa  93.6  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 495 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  36.11 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 341 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  25.28 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15440  predicted dehydrogenase  39.6 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  27.3 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  29.79 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  32.9 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.41 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  29.49 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.72 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.36 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  26.48 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  34.16 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.04 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  39.44 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  38.73 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  35.61 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  39.01 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.46 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  31.75 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  31.53 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  24.49 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  21.28 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.38 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  24.86 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.84 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.4 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  32.72 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.7 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  25.87 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  28 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  28 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>