More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5579 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  881    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  70.32 
 
 		 425 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  70.8 
 
 		 425 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  72.13 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  44.75 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  43.09 
 
 		 496 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  43.03 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  43.03 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  42.35 
 
 		 427 aa  302  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  40.41 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  40.05 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  39.32 
 
 		 470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  39.41 
 
 		 495 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  38.9 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 		 467 aa  252  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  36.59 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  36.18 
 
 		 450 aa  247  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  38.39 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  35.75 
 
 		 474 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  34.57 
 
 		 493 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  38.8 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  26.4 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  26.4 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  26.4 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 699 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.08 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  26.67 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 		 342 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 396 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  24.61 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  22.92 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  22.94 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  23.3 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 357 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 335 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2874  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 		 699 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  31.12 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  29.37 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  30.1 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  25.23 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  31.19 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.13 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  22.16 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>