More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01870 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  100 
 
 
478 aa  991    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  47.37 
 
 
414 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  41.23 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  41.13 
 
 
421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  40.9 
 
 
421 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  43.24 
 
 
414 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  38.35 
 
 
420 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  36.49 
 
 
421 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  37.24 
 
 
416 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 
464 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
416 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  36.93 
 
 
400 aa  241  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02866  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11840)  30.47 
 
 
559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 
440 aa  199  9e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  22.74 
 
 
386 aa  97.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 
385 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 
385 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  25.71 
 
 
393 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  23.02 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
425 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
699 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  24.72 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  23.8 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 
495 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.23 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
337 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  22.51 
 
 
431 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  22.61 
 
 
493 aa  76.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  24.67 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.64 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  29.88 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  36.11 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  23.34 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
347 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  29.67 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  27.44 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  32.48 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  30.41 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.35 
 
 
312 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
403 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.82 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  26.44 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
458 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
333 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.66 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  22.84 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
330 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.52 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  32.69 
 
 
337 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
341 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.36 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.1 
 
 
438 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 
390 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  32.05 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  28.44 
 
 
331 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
330 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
337 aa  63.9  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
334 aa  63.9  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
383 aa  63.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  22.75 
 
 
452 aa  63.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
346 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
435 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.86 
 
 
372 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 
358 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
344 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 
342 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
368 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 
435 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
396 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
358 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.43 
 
 
336 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  36.47 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>