More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4990 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
414 aa  833    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  51.57 
 
 
427 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  54.99 
 
 
414 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  42.09 
 
 
421 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  38.83 
 
 
416 aa  319  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  41.85 
 
 
421 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  43.24 
 
 
478 aa  318  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  38.77 
 
 
420 aa  293  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  39.25 
 
 
464 aa  293  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  43.47 
 
 
400 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  36.58 
 
 
421 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
416 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  35.55 
 
 
440 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02866  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11840)  31.16 
 
 
559 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
385 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
385 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.89 
 
 
393 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
386 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
442 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  27.91 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.98 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  27.06 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  27.79 
 
 
429 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
425 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.87 
 
 
450 aa  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
467 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
427 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
495 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  34.43 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
699 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  28.5 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  33.5 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.04 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.43 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  24.48 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  24.49 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.02 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.84 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 
496 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 
452 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  28.87 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  31.86 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  23.56 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  29.11 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  30.1 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  30.58 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  32.4 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  28.41 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  30.38 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.17 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  36.13 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
330 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.85 
 
 
312 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  28.1 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.88 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  29.27 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>