More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0615 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  795    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  43.78 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  44.04 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  43.15 
 
 		 386 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  43.12 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  24.29 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  24.03 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.86 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 470 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 496 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  23.54 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  24.92 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  27.59 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  24.53 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  33.84 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.24 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 442 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  23.25 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  24.64 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  25.91 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  27.54 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  23.47 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.19 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  27.91 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  25.99 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  20.62 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  21.49 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.08 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  27.95 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  24.31 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.92 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.88 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  30.32 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.54 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  30.95 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  22.26 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  23.04 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  21.87 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  32 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  21.87 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  22.62 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  25.36 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 699 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  24.76 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01139  Putative uncharacterized proteinQutH protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00781]  25 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.707735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.5 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.27 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 458 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  27.56 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>