More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1705 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  100 
 
 		 444 aa  908    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  81.73 
 
 		 435 aa  707    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  59.91 
 
 		 452 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  50 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  49.54 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  49.08 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  50.7 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  54.55 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  47.83 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  47.18 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  46.28 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  48.3 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  44.66 
 
 		 493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  45.75 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  44.85 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  43.28 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  43.54 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  40.05 
 
 		 421 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  39.41 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  39.18 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  39.81 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 699 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  31.91 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 397 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  22.69 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.69 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  22.3 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  34.9 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  27.24 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  23.02 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 		 414 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 715 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  30.39 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  30.35 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  22.16 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  31.53 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  31.96 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  31.96 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  31.96 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  31.96 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  31.96 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  31.96 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.1 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  31.54 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.81 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  23.64 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.89 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.35 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  23.64 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>