More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4641 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  81.35 
 
 		 385 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  81.35 
 
 		 385 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  789    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  72.51 
 
 		 393 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  43.15 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  26.4 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  26.17 
 
 		 421 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  23.82 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  25.59 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  26.76 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  24.69 
 
 		 400 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  28.29 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  25.21 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  21.01 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  22.74 
 
 		 478 aa  97.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 470 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 495 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.44 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  21.89 
 
 		 416 aa  92.8  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  25.39 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 699 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  25.82 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  24.85 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  23.39 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  23.92 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  29.82 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.44 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  20.33 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  22.93 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  38.84 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  29.8 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  23.77 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.58 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  21.74 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  20.66 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.68 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  24.35 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  23.61 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.54 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  31.29 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  23.24 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  33.11 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  33.96 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.52 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.52 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.52 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  20.11 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  31.21 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  35 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.52 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.52 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  22.42 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>