More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 450 aa  892    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  60.13 
 
 		 495 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  59.47 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  56.77 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  58.67 
 
 		 500 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  55.43 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  53.21 
 
 		 474 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  44.72 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  44.49 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  47.84 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  49 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  44.5 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  44.85 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  40.49 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  42.31 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  44.7 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  38.65 
 
 		 442 aa  282  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  36.22 
 
 		 421 aa  262  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  37.07 
 
 		 429 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  35.99 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  34.99 
 
 		 425 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  28.9 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 699 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 		 386 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 390 aa  93.6  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  32.8 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  22.75 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 330 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  36.11 
 
 		 399 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  25.81 
 
 		 421 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  25.81 
 
 		 421 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 404 aa  87  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.66 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  37.67 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  33.49 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  30.2 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  33.56 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.82 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.56 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.54 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  28.21 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  26.57 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.52 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.42 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  24.94 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.3 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.83 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.68 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.87 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  25.87 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.32 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 355 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.64 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.89 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  29.86 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  35.66 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  23.47 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.66 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  25.63 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  23.96 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  35.66 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  35.66 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  35.66 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  35.66 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>