More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2119 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 		 323 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.94 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  60.26 
 
 		 313 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  59.81 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  63.02 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  58.01 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  56.01 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  57.47 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  60.38 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  57.61 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  58.1 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  59.24 
 
 		 312 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  57.59 
 
 		 315 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  57.56 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  56.51 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  51.92 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  55.02 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  55.7 
 
 		 317 aa  331  9e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  33.08 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  61.02 
 
 		 64 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  33.85 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  32.56 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.44 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  31.34 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.57 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.66 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.92 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  26.96 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.1 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.09 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.86 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.1 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  25.89 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  25.89 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.5 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  25.89 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  25.89 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  25.89 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.86 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>