More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0247 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  660    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  67.82 
 
 		 313 aa  434  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  65.27 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.17 
 
 		 321 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  61.95 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  60.7 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  59.81 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  60 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  60.76 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  60.32 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  61.27 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  62.67 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  62.1 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  58.92 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  60 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  57.64 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  59.24 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  53.02 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  65.52 
 
 		 64 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.05 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.38 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.37 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.73 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 385 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  22.62 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5258  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.83 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  21.32 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.35 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  25.66 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.47 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  20.69 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  23.71 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  25.94 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.21 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  25.76 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  28.68 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.76 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  25.94 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  25.94 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  25.94 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  21.72 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  23.36 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  28.75 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  25.47 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  26.83 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  30.22 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  22.48 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>