269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0872 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  100 
 
 		 318 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  65.27 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  63.46 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  58.1 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.14 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.47 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  56.37 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  53.87 
 
 		 314 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  55.95 
 
 		 327 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  57.56 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  54.66 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  56.23 
 
 		 312 aa  344  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  54.17 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  53.18 
 
 		 318 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  54.19 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  50 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  53.87 
 
 		 316 aa  318  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  52.43 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  65.52 
 
 		 64 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  25.44 
 
 		 450 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.7 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  22.81 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  25.26 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  24.14 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.86 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  25.24 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  26.19 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  22.99 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.63 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  23.65 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  22.99 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  22.99 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  22.99 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  22.99 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  24.11 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  22.99 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  30.37 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.92 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.78 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  27.59 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.23 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.82 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.47 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  22.93 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  28.08 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  26.43 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  23.19 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 373 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.87 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  20.87 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 382 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 360 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.24 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.24 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  20.69 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>