More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0950 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0950  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3015  oxidoreductase domain-containing protein  82.96 
 
 
327 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3129  oxidoreductase domain-containing protein  81.73 
 
 
315 aa  534  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1927  oxidoreductase domain protein  81.41 
 
 
315 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1858  oxidoreductase domain-containing protein  74.28 
 
 
318 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28744  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0614  oxidoreductase-like  69.87 
 
 
317 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  62.1 
 
 
318 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.377993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  60.62 
 
 
318 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0822  oxidoreductase domain-containing protein  60.58 
 
 
316 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  59.24 
 
 
323 aa  363  3e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  58.73 
 
 
313 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2972  MviM protein  59.37 
 
 
314 aa  358  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.82127  normal  0.761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0358  oxidoreductase domain-containing protein  56.87 
 
 
314 aa  352  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0872  regulatory protein, LacI  56.23 
 
 
318 aa  344  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0542  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.33 
 
 
321 aa  341  9e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1510  oxidoreductase domain protein  54.11 
 
 
318 aa  341  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1422  oxidoreductase-like  52.53 
 
 
322 aa  335  7e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  50.96 
 
 
311 aa  318  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.47 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3017  hypothetical protein  56.67 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  29.25 
 
 
400 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  31.54 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 
373 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 
347 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
355 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  22.82 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.14 
 
 
386 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
359 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
385 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
393 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
470 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 
495 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.79 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
467 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 
381 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
379 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26.21 
 
 
335 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.13 
 
 
347 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 
389 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
355 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
699 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.13 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
349 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.13 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.13 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.13 
 
 
351 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
431 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
431 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
374 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
385 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.34 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
350 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.94 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 
399 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.92 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 
371 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
378 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
385 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.34 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
382 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  23.53 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
385 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  21.79 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 
429 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  25.58 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.67 
 
 
348 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  22.93 
 
 
405 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  22.93 
 
 
412 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.67 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>