More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0494 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
405 aa  837    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
412 aa  853    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
403 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  27.25 
 
 
384 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 
696 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 
703 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
390 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
669 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  26.3 
 
 
681 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  26.13 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  25.5 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  32.78 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  26.83 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  22.69 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.2 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 
355 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  27.03 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  23.2 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.74 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  23.36 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.86 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  26.46 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  31.67 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  23.78 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  22.25 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  27.85 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.43 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  26.95 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.53 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  22.75 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  22.06 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.47 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
383 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  25.32 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  25.32 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  25.32 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  25.32 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  25.32 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
336 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.66 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  29.75 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  25.35 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  24.14 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>