More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 397 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  48.69 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  47.07 
 
 		 700 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  47.27 
 
 		 696 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  47.16 
 
 		 703 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  44.3 
 
 		 669 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  40.21 
 
 		 681 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  39.49 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  40.68 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  37.89 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.32 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.28 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  23.14 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  21.6 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  27.24 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.51 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  32.64 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  36.78 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  25.74 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3374  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.54 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.114989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  35.66 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.53 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  29.63 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.1 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  36.26 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.27 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  40 
 
 		 348 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.5 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.49 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.07 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  34.84 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  34.87 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.41 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.36 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  28.06 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  33.88 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 337 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  35.37 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  33.89 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  29.07 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  33.79 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  32.54 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 353 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>