More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2032 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
390 aa  764    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  67.83 
 
 
384 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  55.29 
 
 
681 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  51.6 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  44.33 
 
 
420 aa  263  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  44.11 
 
 
700 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 
703 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  44.27 
 
 
696 aa  238  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
669 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  40.69 
 
 
403 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  37.63 
 
 
397 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.88 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.15 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  25.8 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  21.18 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  29.38 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  22.39 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  21.23 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.93 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.08 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 
337 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  22.14 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.15 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  26.3 
 
 
366 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  29.41 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
483 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
352 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  28.92 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  24.2 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  23.21 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  24.11 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.88 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.94 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  29.82 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  22.87 
 
 
350 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 
444 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.59 
 
 
377 aa  59.7  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  28.28 
 
 
350 aa  59.7  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  24.71 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.81 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  30 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.74 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 
345 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.74 
 
 
348 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  25.56 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  24.14 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.21 
 
 
335 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2313  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
616 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.21 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>