More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3331 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  55.15 
 
 		 700 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 703 aa  1383    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  64.9 
 
 		 696 aa  813    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  44.84 
 
 		 669 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  42.2 
 
 		 681 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  58.44 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  46.3 
 
 		 384 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  49.87 
 
 		 383 aa  284  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  46.91 
 
 		 397 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  46.21 
 
 		 403 aa  260  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  43.8 
 
 		 390 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  43.93 
 
 		 285 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  41.05 
 
 		 295 aa  172  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  37.19 
 
 		 313 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 651 aa  145  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  36.27 
 
 		 319 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  39.78 
 
 		 290 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 412 aa  127  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  35.42 
 
 		 293 aa  127  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  36.84 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  34.5 
 
 		 300 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 405 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  32.62 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  33.1 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  35.44 
 
 		 306 aa  95.5  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 284 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 355 aa  88.6  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 347 aa  88.2  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 		 342 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 		 375 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  39.86 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  35.5 
 
 		 335 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.87 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 376 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 373 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 352 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  27.5 
 
 		 372 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 397 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 341 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  40.16 
 
 		 376 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  36.91 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  34.27 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  32.87 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.57 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.34 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 350 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 385 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 350 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 335 aa  67  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.57 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.75 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  29.29 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.46 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  31.21 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.86 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  29.09 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  25.26 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  30.97 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  27.76 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  33.02 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  23 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>