19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  53.18 
 
 		 340 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  54.92 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  41.46 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  44.18 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  34.4 
 
 		 681 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  32.71 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  35.23 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  29.31 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 696 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 669 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 700 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  30.51 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 		 703 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  30.94 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 651 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 		 663 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5678  hypothetical protein  25.38 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.814223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>