More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3133 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  54.68 
 
 
700 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  65.03 
 
 
703 aa  815    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
696 aa  1383    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  45.56 
 
 
669 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  59.75 
 
 
420 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  40.96 
 
 
681 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  47.4 
 
 
397 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  48.3 
 
 
383 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  43.47 
 
 
384 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  45.65 
 
 
403 aa  256  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  44.78 
 
 
390 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  40.73 
 
 
285 aa  185  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  42.01 
 
 
295 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
403 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  35.79 
 
 
313 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  37.02 
 
 
319 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  38.01 
 
 
290 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  34.97 
 
 
651 aa  145  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  34.38 
 
 
293 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  35.54 
 
 
340 aa  127  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 
405 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 
412 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  34.47 
 
 
306 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  32.14 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  32.95 
 
 
300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 
663 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
335 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.73 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
462 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
352 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 
387 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
373 aa  77  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.55 
 
 
353 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.44 
 
 
360 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.44 
 
 
360 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.69 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
341 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  21.89 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  29.66 
 
 
350 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 
326 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  23.57 
 
 
370 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 
362 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  27.07 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  31.03 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  21.27 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.61 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  25 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  21.65 
 
 
357 aa  67  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.95 
 
 
349 aa  67  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
425 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  32.7 
 
 
332 aa  67  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
365 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
341 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  30.61 
 
 
421 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 
429 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
385 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  33.91 
 
 
467 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 
361 aa  65.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
357 aa  65.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
344 aa  65.1  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 
451 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  31.21 
 
 
340 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
367 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  33.1 
 
 
340 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
359 aa  64.7  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  27.12 
 
 
372 aa  64.7  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 
360 aa  64.7  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  31.29 
 
 
328 aa  64.7  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.69 
 
 
353 aa  64.7  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  36.73 
 
 
338 aa  64.7  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.97 
 
 
347 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  27.15 
 
 
394 aa  64.3  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 
377 aa  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
359 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
335 aa  63.9  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.02 
 
 
339 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.34 
 
 
350 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 
369 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>