18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2904 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  34.41 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  34.8 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  33.89 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  31.37 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  29.2 
 
 		 340 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  28.52 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  31.87 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  31 
 
 		 681 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  29.6 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 700 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 669 aa  95.5  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 		 703 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  31.47 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 		 663 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 696 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 651 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  34.52 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>