19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1708 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  58.84 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  51.92 
 
 		 681 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  46.9 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  43.93 
 
 		 703 aa  194  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 700 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  40.79 
 
 		 696 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  43.41 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 651 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  41.61 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  38.26 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 		 669 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  37.18 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  36.16 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  32.27 
 
 		 337 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  34.56 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 663 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 		 1286 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>