22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4820 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  54.92 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  51.66 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  44.01 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  41.07 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  36.36 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  36.64 
 
 		 681 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  35.52 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 		 700 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  34.93 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  33.89 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 651 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  35.38 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 		 696 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  34.5 
 
 		 703 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 669 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 663 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  33.48 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2201  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5678  hypothetical protein  24.68 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.814223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.23 
 
 		 1286 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0431  hypothetical protein  22.64 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>