23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1928 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  594  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  46.21 
 
 
340 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  44.52 
 
 
337 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  41.43 
 
 
300 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  41.84 
 
 
306 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  39.7 
 
 
681 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  38.64 
 
 
285 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  41.18 
 
 
295 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  35.61 
 
 
319 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
696 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  36.4 
 
 
703 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  34.24 
 
 
700 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  35.45 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 
669 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  35.86 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  33.86 
 
 
651 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 
663 aa  106  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2201  hypothetical protein  25.4 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5678  hypothetical protein  22.02 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.814223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0431  hypothetical protein  22.39 
 
 
341 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930481  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4107  hypothetical protein  26.52 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.73 
 
 
1286 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>