More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3318 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  54.68 
 
 		 696 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 700 aa  1383    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  55.01 
 
 		 703 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  74.07 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 		 669 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  42.23 
 
 		 681 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  47.07 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  47.3 
 
 		 383 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  42.04 
 
 		 384 aa  261  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  44.11 
 
 		 390 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  40.71 
 
 		 403 aa  209  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  45.98 
 
 		 285 aa  188  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  43.75 
 
 		 295 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 403 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  38.81 
 
 		 313 aa  163  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  34.96 
 
 		 319 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  38.71 
 
 		 290 aa  142  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 651 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  34.24 
 
 		 293 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 405 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  35.84 
 
 		 300 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  35.63 
 
 		 340 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 663 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  31.9 
 
 		 337 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 405 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 284 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 355 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 337 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 342 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 		 360 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 338 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.17 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  35.37 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 		 361 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 366 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.42 
 
 		 363 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 335 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 360 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 349 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 360 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 341 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.24 
 
 		 1286 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  26.17 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.69 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.55 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 467 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26 
 
 		 335 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  28.75 
 
 		 345 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  21.59 
 
 		 370 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 357 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1468  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 316 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.88 
 
 		 331 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 		 344 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 353 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 397 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 485 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 334 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 376 aa  55.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0411  oxidoreductase-like  30.5 
 
 		 328 aa  54.7  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.76 
 
 		 330 aa  54.7  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 371 aa  54.7  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 371 aa  54.7  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 		 345 aa  54.7  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 434 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  24.57 
 
 		 371 aa  54.3  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 336 aa  54.3  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 368 aa  53.9  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  30.67 
 
 		 334 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.54 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  29.66 
 
 		 368 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  30.07 
 
 		 328 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 353 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.45 
 
 		 311 aa  53.5  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  35.14 
 
 		 332 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>