18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2031 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  61.68 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  49.82 
 
 		 681 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  46.85 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  42.01 
 
 		 696 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  44.53 
 
 		 700 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  43.6 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  43.68 
 
 		 651 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  42.81 
 
 		 703 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  41.51 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  41.97 
 
 		 669 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  35.74 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  40.88 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  37.59 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  37.07 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  36.43 
 
 		 337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 663 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>