More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3363 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 669 aa  1314    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  45.18 
 
 		 696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  44.84 
 
 		 703 aa  445  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 		 700 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  39.76 
 
 		 681 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  45.01 
 
 		 420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  43.34 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  43.85 
 
 		 383 aa  253  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  43.8 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  39.27 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  40.69 
 
 		 390 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  40.46 
 
 		 285 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  40.22 
 
 		 295 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  37.71 
 
 		 319 aa  151  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 403 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  37.72 
 
 		 340 aa  141  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  35.42 
 
 		 313 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  32.17 
 
 		 293 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  35.13 
 
 		 651 aa  127  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  35.77 
 
 		 290 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  33.68 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  32.88 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 		 412 aa  115  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 		 405 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  32.75 
 
 		 300 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  33.88 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 405 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 284 aa  95.5  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 345 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 331 aa  87  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  33.49 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  37.75 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 368 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  34.36 
 
 		 352 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  33.54 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 367 aa  77  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 355 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  28.42 
 
 		 339 aa  73.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 355 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 338 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  29.94 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 342 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 344 aa  72  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 335 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 366 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 326 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  26.87 
 
 		 390 aa  70.5  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 339 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.7 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  29.77 
 
 		 404 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  25.98 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.25 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  30 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 388 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  31.4 
 
 		 366 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  28.95 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  31.35 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.52 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  26.27 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  36.61 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.66 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  30.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  30.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  30.43 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.91 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  26.54 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>