22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5254 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  53.18 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  51.66 
 
 		 300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  41.9 
 
 		 306 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  45.86 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  39.34 
 
 		 681 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  36.16 
 
 		 285 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  33.92 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  37.41 
 
 		 669 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  38.31 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  37.93 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 		 700 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 		 696 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  36.98 
 
 		 703 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  34.12 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 663 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0431  hypothetical protein  21.71 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2201  hypothetical protein  32.35 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4107  hypothetical protein  23.96 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5678  hypothetical protein  21.51 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.814223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>