18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  49.83 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 651 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  46.69 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  47.24 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  46.72 
 
 		 681 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  43.46 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  41.9 
 
 		 663 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  38.81 
 
 		 700 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  35.79 
 
 		 696 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  37.19 
 
 		 703 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  34.87 
 
 		 669 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  37.45 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  34.93 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  35.45 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  32.61 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  30.63 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>