20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1010 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  41.46 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  41.9 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  44.01 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  41.5 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 		 681 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  34.8 
 
 		 284 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  34.56 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  35.59 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  32.61 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  33.1 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  34.47 
 
 		 696 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 669 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 700 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 651 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  31.64 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  35.44 
 
 		 703 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5678  hypothetical protein  24.01 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.814223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6423  hypothetical protein  24.26 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00773435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>