19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0500 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  47.28 
 
 
681 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  43.46 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  43.31 
 
 
319 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  41.61 
 
 
285 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  38.91 
 
 
651 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 
696 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  36.88 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  40.15 
 
 
703 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  38.71 
 
 
700 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  35.77 
 
 
669 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 
663 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  34.12 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  35.86 
 
 
293 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  29.41 
 
 
337 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  33.48 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  31.64 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  32.44 
 
 
284 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 
1286 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>