More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1496 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 681 aa  1332    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  42.06 
 
 		 700 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 		 696 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  42.3 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  39.76 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  55.61 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  55.29 
 
 		 390 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  51.72 
 
 		 383 aa  304  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1708  hypothetical protein  51.92 
 
 		 285 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2031  hypothetical protein  49.45 
 
 		 295 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  39.8 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  40.36 
 
 		 397 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05190  hypothetical protein  41.84 
 
 		 319 aa  193  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05220  hypothetical protein  44.7 
 
 		 313 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.900429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0500  hypothetical protein  47.28 
 
 		 290 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147389 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1928  hypothetical protein  38.79 
 
 		 293 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 403 aa  170  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5254  hypothetical protein  39.22 
 
 		 340 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  43.67 
 
 		 651 aa  162  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1010  hypothetical protein  37.37 
 
 		 306 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124227  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05540  hypothetical protein  34.13 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4820  hypothetical protein  36.04 
 
 		 300 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0001825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  41.3 
 
 		 663 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 		 405 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2904  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 284 aa  97.8  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.96 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 		 357 aa  79.7  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  26.92 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  23.27 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 350 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.9 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 368 aa  70.5  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 325 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.76 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  28.28 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  23.32 
 
 		 370 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  37.14 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  32.77 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.88 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  26.14 
 
 		 345 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 353 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 364 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 387 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 403 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  25.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  25.73 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  25.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  25.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  25.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  25.3 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  25.3 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  25.73 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  26.14 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  24.9 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.86 
 
 		 350 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  25.44 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>