145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0630 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0630  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
405 aa  832    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
403 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0494  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.340845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0518  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3318  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
700 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0309567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3331  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
703 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3117  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3133  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 
696 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1707  putative oxidoreductase  30.17 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3363  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
669 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0941796  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29690  predicted dehydrogenase  29.32 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1496  dehydrogenase-like protein  27.24 
 
 
681 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0593  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933097  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05210  predicted dehydrogenase  30.4 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25.48 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  38.95 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2032  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.13 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  27.98 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  22.62 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.07 
 
 
352 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  26.32 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  38.3 
 
 
476 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
337 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 
350 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 
355 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 
359 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  32.48 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
374 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  28.39 
 
 
336 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
350 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.14 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 
352 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  34.55 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  28.4 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  38.2 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.35 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
350 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.35 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  27.54 
 
 
330 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 
342 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  28.92 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  21.85 
 
 
340 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
355 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  27.03 
 
 
335 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.43 
 
 
330 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 
310 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
366 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
371 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
476 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  24.74 
 
 
372 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
444 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
355 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  33.06 
 
 
345 aa  46.6  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  31.31 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
483 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  33.94 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  28.26 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0120  Inositol 2-dehydrogenase  31.25 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.47 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.52 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  30.85 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  25.6 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  34.07 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  23.04 
 
 
312 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15440  predicted dehydrogenase  29.58 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>