More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0047 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
471 aa  983    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  62.82 
 
 
477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  49.24 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  37.85 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  40.65 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  37 
 
 
439 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  34.85 
 
 
428 aa  252  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  33.96 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 
428 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  32.78 
 
 
464 aa  243  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
451 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
424 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
435 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
434 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
458 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
462 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
432 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
435 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
423 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
421 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
434 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
455 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
427 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 
448 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
451 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
440 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.37 
 
 
437 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
448 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
436 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
445 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
483 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
476 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
485 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 
484 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 
447 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
451 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 
444 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
459 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 
490 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
462 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 
481 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
473 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  25.93 
 
 
450 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
478 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  24.14 
 
 
458 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
462 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
451 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
480 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 
487 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 
444 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
460 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 
441 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 
501 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  37.97 
 
 
362 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  24.49 
 
 
459 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
403 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  22.51 
 
 
452 aa  96.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 
359 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
377 aa  87.8  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.66 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
359 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.17 
 
 
350 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
377 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.76 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  30.61 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  38.14 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.56 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>