More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4623 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 400 aa  828    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  65.98 
 
 		 395 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  65.98 
 
 		 395 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  65.03 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  65.58 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  59.27 
 
 		 399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  37.93 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  37.68 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.77 
 
 		 347 aa  113  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.34 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  35.87 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.15 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 667 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  32.66 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 339 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 		 336 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  28.12 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  30.69 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.86 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 468 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  37.19 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  33.51 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.36 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 331 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 362 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  29.51 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  28.86 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32.84 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  29.87 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  30 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.55 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 326 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.6 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 338 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.24 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  25.61 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 		 354 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  25.61 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 699 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  25.61 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  31.53 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.78 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  25.26 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.63 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>