More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4727 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  68.55 
 
 		 476 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 483 aa  1010    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  54.53 
 
 		 473 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  54.02 
 
 		 499 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  51.78 
 
 		 487 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  51.69 
 
 		 484 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  51.54 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  52.39 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  42.77 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  41.37 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  43.08 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 		 447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  37.91 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  32.53 
 
 		 468 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  33.4 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 448 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 436 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  34.88 
 
 		 437 aa  156  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  35.92 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 439 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 459 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  34.3 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  35.93 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  31.75 
 
 		 501 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  31.74 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  31.17 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 680 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.56 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  32.12 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  34.17 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.15 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  35 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.84 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.22 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>