More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6533 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 460 aa  952    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  53.41 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  53.48 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  52.62 
 
 		 485 aa  498  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  51.5 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  47.74 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  36.17 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 452 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 462 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  26.08 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  30.71 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 444 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 448 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  22.85 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 477 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.7 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  25.5 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 501 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 476 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  35.91 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 		 459 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 356 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.87 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.87 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.59 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.34 
 
 		 336 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.59 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.06 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  31.84 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.06 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.06 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  35.66 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  35.66 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>