More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6570 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 448 aa  928    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  54.81 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  53.9 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  48.65 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  46.44 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  47.68 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  44.49 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  39.31 
 
 		 480 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  38.96 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  38.06 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 483 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  34.45 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 471 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.26 
 
 		 490 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 499 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 		 485 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 462 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.95 
 
 		 458 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 487 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  28 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  22.77 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  27.57 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  27.57 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.78 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.42 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  26.35 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  23.94 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  30.17 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  24.32 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  25.56 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  25.56 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  21.66 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  21.66 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  25.19 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  25.19 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  25.19 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.95 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>