More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1465 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  79.82 
 
 
459 aa  788    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  79.82 
 
 
459 aa  787    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  71.59 
 
 
456 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  79.61 
 
 
459 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  71.81 
 
 
456 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  79.61 
 
 
459 aa  786    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  71.81 
 
 
456 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.32 
 
 
455 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  81.9 
 
 
467 aa  817    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  80.04 
 
 
459 aa  788    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  80.04 
 
 
459 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  80.04 
 
 
459 aa  788    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  79.82 
 
 
459 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  80.48 
 
 
459 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  959    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  50.84 
 
 
481 aa  486  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  51.97 
 
 
473 aa  467  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  45 
 
 
467 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  44.37 
 
 
482 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  44.21 
 
 
461 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  40.88 
 
 
471 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  45.67 
 
 
474 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  40.69 
 
 
458 aa  359  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 
474 aa  350  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.6 
 
 
495 aa  345  7e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  40.24 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  39.09 
 
 
449 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  39.19 
 
 
464 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  38.52 
 
 
451 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.03 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  22.68 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.69 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
347 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
484 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  28.83 
 
 
336 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  24.87 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  30.67 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.3 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  33 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.65 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>