More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2811 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  100 
 
 
314 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  79.05 
 
 
319 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  77.78 
 
 
319 aa  520  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  78.73 
 
 
319 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  78.53 
 
 
319 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  76.19 
 
 
319 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  76.28 
 
 
318 aa  504  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  75.64 
 
 
318 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  74.68 
 
 
312 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  74.04 
 
 
320 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  71.79 
 
 
317 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  73.48 
 
 
317 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  63.58 
 
 
315 aa  417  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  54.17 
 
 
315 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  41.35 
 
 
312 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.28 
 
 
353 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.5 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
381 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  31.48 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  34.29 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.22 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.1 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  32.35 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  31.05 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  23.14 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  25.39 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.65 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.41 
 
 
346 aa  79  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  26.56 
 
 
346 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.63 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.9 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  28.09 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.29 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.71 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.08 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.94 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
715 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  27.57 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  34.75 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.86 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.62 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  23.46 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  30.16 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.4 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  32.35 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.5 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.4 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.91 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  25.43 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  22.88 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  26.43 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  31.62 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  23.22 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  31.94 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.03 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>