More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0329 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  100 
 
 		 318 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  89.84 
 
 		 319 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  87.74 
 
 		 318 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  87.03 
 
 		 320 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  85.76 
 
 		 319 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  84.81 
 
 		 319 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  84.18 
 
 		 319 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  82.59 
 
 		 319 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  78.48 
 
 		 317 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  75.64 
 
 		 314 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  74.12 
 
 		 312 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  66.45 
 
 		 315 aa  437  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  67.19 
 
 		 317 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  56.15 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  41.32 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.13 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  35.04 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 		 358 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  28.69 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.57 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.7 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  32.37 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.55 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  37.12 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.2 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  29.39 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.22 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  25.96 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  24.05 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  26.09 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  31.47 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.87 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.93 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  27.07 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.64 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.76 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.76 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  35.34 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.16 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.19 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  25.32 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  31.65 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  25.88 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  25.76 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  28.65 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  26.5 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>