More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1753 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
400 aa  823    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  90.68 
 
 
400 aa  748    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  73.48 
 
 
407 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  72.04 
 
 
399 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  68.34 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  64.75 
 
 
430 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  63.75 
 
 
418 aa  511  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  64.43 
 
 
435 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  46.27 
 
 
431 aa  352  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 
367 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
372 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 
374 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
397 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  32.57 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
377 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
381 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  29.59 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  31.46 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  30.77 
 
 
482 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.39 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
345 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  34.27 
 
 
320 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 
363 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  28.75 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  34.51 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  34.25 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  33.59 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  31 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  34.27 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.5 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  37.06 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  29.29 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  29.58 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  36.59 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  30 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.5 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  31.06 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.73 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  27.45 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 
459 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
459 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  31.82 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  26.2 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.15 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>