More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1635 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 407 aa  826    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  73.48 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  72.73 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  67.93 
 
 		 399 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  65.15 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  61.56 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  61.06 
 
 		 418 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  62.41 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  47.7 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 397 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  28.54 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  30 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.13 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  27.5 
 
 		 366 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.73 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  35.21 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  30.56 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  30.06 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  26.83 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.87 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.43 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.82 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  28.85 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.97 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  34.29 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  33.78 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.03 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.24 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.17 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.87 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  25.1 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.96 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 319 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  29.66 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.62 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>