More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3384 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 400 aa  821    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  90.68 
 
 		 400 aa  748    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  72.73 
 
 		 407 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  71.03 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  67 
 
 		 396 aa  554  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  64.91 
 
 		 430 aa  531  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  62.84 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  64.43 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  46.97 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  30.21 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.79 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.28 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.78 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  35.21 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.37 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  33.56 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  34.13 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  27.92 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  34.42 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  36.36 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2041  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.284403 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  32.8 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  34.82 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.81 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  34.78 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  29.3 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.56 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  26.25 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.24 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  36.67 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  32.17 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  26.25 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>