More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2041 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2041  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
348 aa  680    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.284403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  30.85 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  36.31 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2532  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  29.68 
 
 
396 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  37.5 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
474 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
451 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
459 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
459 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  22.41 
 
 
435 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
459 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
459 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.47 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.26 
 
 
459 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.26 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  34.26 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
459 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
364 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 
459 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 
467 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
431 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
406 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 
459 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 
389 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
381 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  26.76 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  22.96 
 
 
360 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  30.2 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  22.72 
 
 
458 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  28.51 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 
374 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
435 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.86 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 
384 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.86 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
390 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
378 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
371 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3492  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.05 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00854332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  34.01 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
390 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  22.74 
 
 
449 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.64 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  22.28 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
390 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  32.29 
 
 
379 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  23.91 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.05 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
393 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  28.99 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  27.12 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  25.54 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>