More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25460 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  879    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  64.91 
 
 		 400 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  64.75 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  61.56 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  62 
 
 		 396 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  61.25 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  54.5 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  54.23 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  41.24 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 397 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  30.02 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.91 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.01 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  29.81 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.51 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  32.94 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  26.37 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.76 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.56 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.02 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 		 348 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 315 aa  67  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 403 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  27.95 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  25.16 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.33 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.33 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  30.95 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  24.91 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  27.27 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  27.27 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  27.27 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.15 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  20.7 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  26.76 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  30.81 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  28.66 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  27.27 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2041  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.284403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  23.17 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>